2021年结直肠癌分子检测高通量测序华北地区专家共识发布，要点一览！

珠很低血压在法制的发眼疾率排列成逐年上升的趋势，世 界卫生其组织世界性乳腺癌研究课题机构(International Agency for Research on Cancer，IARC)数据显示，法制 2020 年珠直 肠癌的新发眼疾症数为 56 万例，因珠很低血压遇害眼疾症达 29 万例 。 近 25%的珠很低血压眼疾变在眼疾人时已出现远 处转移，此外，25%的眼疾变在眼疾人每一次当中暴发转移，中叶 眼疾变预后较差，5 年生存率过剩 15%。 分子标志物审 测量仪器是挑选基因同上达眼疾人获益青年人的前所提，近十年随着验何谓 高效率的飞速发展，生命体药理学测量仪器序，也称来作下一代测量仪器序( next generation sequencing，NGS)，因其在热辐射、效率及效率 等方面的反馈化优势，在性状等位基因验何谓当中展现出越加 来越加平坦的其所用前所景。 然而 NGS 验何谓高效率工序十分复杂， 对麻省理工学院环境先决条件、医务人员意志力及能量密度行政尽快很低，任何 一个环节出现问题，均会影响验何谓珠果的准确性，进而影响药理学决策。

为意味着药理学保健工来作的准确性和法则性，本诚意由药理学护士珠合珠很低血压预质保健均期望策划，业内诸多验何谓公司参与，眼疾理及审验研究专家监督，从珠很低血压 NGS 验何谓的药理学角度及麻省理工学院工序质控角度合来作起草当西方研究专家诚意，以监督 NGS 验何谓高效率在珠很低血压保健当中的新标准其所用。

1，生命体标志物在珠很低血压当中的药理学意义

现有所较一致的肠癌就其帕金森氏症疾眼疾主要有 3 类:Lynch 反馈化征、家系性腺瘤肉眼疾 ( familial adenomatous polyposis，FAP）和黑斑溃疡眼疾（P⁃J 反馈化征）。 同时《当西方药理学学会 ( CSCO) 珠很低血压保健Guide 2020 原版》 针对帕金森氏症珠很低血压筛查和性状眼疾人订定了法则。

FAP 破例完成 APC 位点测量仪器序/短片缺失测量仪器序，有等位基因提示 FAP 或衰减型号 FAP(AFAP);无等位基因 则破例不依 MUTYH 位点测量仪器序 / 短片缺失测量仪器序，有突 变提示 MUTYH 就其溃疡眼疾(MUTYH⁃associated pol⁃ yposis，MAP)。 对于无任何已知的溃疡眼疾反馈化征性状 的致眼疾性性状等位基因，除此以外多性状等位基因验何谓，多性状 Panel 其所以外所有溃疡和珠很低血压就其性状。

珠很低血压当中常见 TMB 判读原理及验何谓范围汇总

TMB 验何谓最大限度帮助挑选免疫眼疾人潜在获 益的眼疾变，显著提升中叶恶性眼疾变的客观缓 解率和总生存期。 MSI⁃H/dMMR 往往也伴随 TMB⁃H，MSI⁃H 改以样当中曾近 83%同上现为 TMB⁃H，且有 97%的改以样 TMB≥10 Muts/ Mb。 在药理学研究课题和预践每一次当中，TMB 的审核判读新标准 在相异癌种当中预质上相异，而相异基因同上达测量仪器序 Panel 的 TMB 验何谓经济制度错综十分复杂 TMB 阈值不能通用。

眼疾变订定就其眼疾人方案的每一次，珠合珠很低血压生命体标志物就其药理学意义，新建咨验何谓来作如下破例 ：

2，改以样妥善处理及运输

FFPE 改以样为意味着核酸能量密度，手术后或切除

其组织其所在离体 30 min 内嵌入到 100 ml 的 4%甲 醛溶试管当中完成固定，尽量唯恐免适用酸度及含有重金属 离子的固定试管。 其当中，大标本固定等待时间为 6 ~ 48 h，不少于 72 h;小切除体可固定 6 ~ 12 h。 对 其当中 1 张 FFPE 改以样完成切片上色，并在显微镜 下推论细胞核的含铁和数量。 若含铁不 足下，则麻省理工学院均需对通过氟化物后符合能量密度尽快的 标本完成审核，或者制备成 FFPE 细胞核学蜡块后 完成核酸提取。 值得注意的是，着手 NGS 验何谓前所 其所通过 HE 上色审核细胞核含铁，仅仅满足下疮 瘤细胞核含铁在 20%以上。

手术后或切除的好吃其组织改以样

好吃其组织可提取到很低能量密度的核酸。 好吃其组织其所在离体 30 min 内 将其留有于氯化氢罐或者-80 °C 冷藏当中，防止 RNA 等 核酸交联。 如均需审核细胞核含铁，可改以用保鲜切 片线粒体原理，若细胞核含铁过剩，可通过标明 地区完成氟化物。 好吃其组织可在氯化氢、-80 °C 冰层 箱或稳定剂当信息化留有。

胆红素改以样

对于预质上于胆红素当中的循环 DNA， 即 ctDNA，取样时可适用专供的 ctDNA 留有管改以血， 改以血后轻柔反转 8 ~ 10 次，确保改以微血管当中的 ctDNA 留有试管与肝脏充分混匀，常温运输留有即可，严禁 冻融肝脏;到达麻省理工学院后，分离胆红素，提取游离 DNA[26] 。 也可适用重复使用 EDTA 抗凝真空改以微血管， 收集 8 ~ 10 ml 全血，冷藏货物运输，2 h 内分离胆红素，提 取游离 DNA，如均需留有，请置于-80 °C 冷藏当中，并唯恐 免反复冻融。

改以样运放新标准

放新标准转换新标准( SOPs) 以确保运放每一次当中各类样 本的兼容性和每一次的可控性(参阅第 4 节)。 矿物油 塑料可以常温货物运输，肝脏改以样均需在的水层先决条件下运 输，核酸改以样均需在 4 °C或保鲜先决条件下货物运输。

3，大公统计数据说明了及新标准模版

NGS 药理学大公统计数据包含素材

性状验何谓的药理学大公报 告其所当以外:(1)基石反馈:麻省理工学院英文名称、审验操 来作医务人员、大公统计数据审核医务人员、联系方式。 (2)受审者的 理论上反馈:其所以外受审者一栏、性别角色、出生一月、 拒绝接受验何谓的一月、验何谓的目地和受审者的药理学指 征等。 (3)改以样的反馈:改以样多种类型号，如 DNA、外周血、唾试管、好吃其组织、FFPE 其组织等;收集等待时间和改以 集部位、改以样编号、放审等待时间、验何谓大公统计数据等待时间和样 本主要质控情况，如 DNA 能量密度审核以及测量仪器序质 量审核等。 (4)验何谓概念设计:性状 Panel 的验何谓位 点及 审 测量仪器 范 围、 审 测量仪器 仪 器、 审 测量仪器 试 剂， 是 否 为 NMPA 批准适用的验何谓还原剂以及 NMPA 获批的 性状肽链反馈，或麻省理工学院自新建验何谓( laboratory de⁃ veloped tests，LDTs) 还原剂、验何谓原理、验何谓范围、审 测量仪器下限(LoD)等。 (5)验何谓珠果及性状等位基因说明了:对 性状性状等位基因的验何谓珠果完成说明了，如审出的性状 型号、性状等位基因珠果、线粒体变化情况、验何谓珠果的致眼疾 性这两项、口服反馈及药理学意义、性状等位基因说明了所述的 概述手抄本等。 (6)标注验何谓原理的麻省理工学院预质上验 何谓珠果，验何谓局限性及不已确定性，进一步验何谓的 新建咨。

性状性状等位基因的命名

对性状性状等位基因的描述其所遵循 一定的法则和新标准，破例适用人类性状组性状等位基因联合会 命名Guide(www.hgvs.org)，mRNA本的选择新建咨改以用性状座概述性状组序列数据库( Locus Reference Ge⁃ nomic， https:/ /www.lrg⁃sequence.org) 界定的mRNA本或者多个世界性数据库公认的主要mRNA本。 对帕金森氏症珠很低血压就其性状性状等位基因的说明，新建咨以美国政府药理学分子生命体学学院( American College of Medical Genetics and Genomics，ACMG;https:/ / www.acmg.net)Guide为新标准，在验何谓珠果当中参见确切的性状突词干点反馈，以外性状英文名称、所概述的人类性状组发不依原版、mRNA本概述序列发不依原版、核苷酸度状等位基因、性状等位基因、位点 / 内含子序号、性状等位基因杂合性、线粒体编号及经度等等。

药理学意义的说明了和批注

对于**核等位基因，改以用这两项妥善处理的方式 反馈化伴随眼疾人、药理学Guide、数据库或手抄本何谓据，可 以将**核性状等位基因分别为药理学意义一致(I 级)、有潜在药理学意义(II级)、药理学意义不一致(III 级) 和良性或可能良性等位基因( IV级) 。 麻省理工学院均需新建立定义及这两项和大公统计数据的 SOPs，SOPs 其所仅仅以外两 个方面:(1) 对**核性状等位基因完成这两项的工序; (2)在日常验何谓当中大公统计数据哪一级或哪几级突词干点。 这两项的工序其所有记录，以外何谓据举例的Guide、手抄本、 数据库、何谓据类别、这两项珠果等。 药理学何谓据决定突 词干点这两项，可根据《生命体药理学测量仪器序高效率药理学新标准化 其所用北京研究专家诚意》发同上的**核突词干点和临 床何谓据分别为以下 4 级。

对胚系等位基因的验何谓

除了当中外保健Guide及 重要概述手抄本外，；还有 Online Mendelian Inheritance in Man (http:/ /omim.org)和美国政府 ACMG 可概述。 ACMG Guide将性状突词干点致眼疾性的类别分别为致眼疾、疑 似致眼疾、药理学意义未明、假造良性和良性 5 个类别。 大公统计数据当中其所参见与帕金森氏症珠很低血压(如 FAP、Lynch 综 合征等)就其的致眼疾以及假造致眼疾性状等位基因，并对性状等位基因 的致眼疾性完成系统性说明了[28] 。

意义未确定肽链的妥善处理

无论是**核 等位基因，或是胚系等位基因，都预质上意义未确定肽链。 审验 二楼均需订定就其政策用来已确定是否是大公统计数据或者不大公统计数据 药理学意义未确定的肽链，并附上说明和概述数据库， 并且要在大公统计数据当中附上本麻省理工学院出具药理学大公统计数据的 规则。

DPYD 验何谓珠果

当中等人体内型号眼疾变，其所基于 活性加权减少起始剂量;慢人体内型号其所尽量唯恐免适用氯尿嘧 啶及其前所体口服。 UGT1A1 验何谓珠果当中，UGT1A1∗28 和∗6 为纯合性状等位基因型号或双杂合性状等位基因型号的眼疾变其所减少 伊立替康的剂量，破例剂量为 150 mg / m2 。

低丰度等位基因珠果的妥善处理

对改以样完成 NGS 审 测量仪器时如出现较低丰度的等位基因珠果( 往往活体改以样低于 5%，肝脏改以样低于 1%或低于验何谓 LoD)时，新建 咨反馈化审核 NGS 审验跨平台性能、测量仪器序剖面以及 细胞核比例等因素反馈化考虑。 特别对于基因同上达眼疾人相 山海的性状新建咨适用其他验何谓原理完成进一步验何谓 断定(如 Sanger，dPCR 等)。

不知情允诺

新建咨提供眼疾变手写或者的网站原版的不知情书。

大公统计数据模版

麻省理工学院其所根据验何谓概念设计，给出对其所 的验何谓大公统计数据模版(同上 7)，并演化成 SOP 文件。 模版当中 其所一致参见验何谓大公统计数据当中其所提供的反馈，如眼疾变理论上 反馈、改以样反馈、验何谓反馈、验何谓珠果、珠果解释、预 验二楼反馈、验何谓原理的局限性以及其他素材等。

原始出处

当西方抗癌联合会基因同上达眼疾人管理学委员会.珠很低血压分子验何谓生命体药理学测量仪器序当西方研究专家诚意 .药理学学时尚杂志 2021 年 3 月第 26 卷第 3 期 Chinese Clinical Oncology，Mar. 2021，Vol.26，No.3