Cell | 染色质激活或抑制状态决定了核小体分离的共通点

2022-01-03 04:15:09 来源:
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肝细胞会内部结构通过促成或抑制作用该内部结构的磷酸化可以控制性状组的功能和细胞会身份断定。这些肝细胞会内部结构中的存在特定的甲基化转译后去除(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定磷酸化长时间都与关,并可促成抑制作用性染色体内部结构的产生,影响性状的表达出来。为了在细胞会分裂时依然保持性状表达出来程序的正确性,要求肝细胞会内部结构的水分子特征也需要在子代细胞会中的建起。建起不尽都与同类HG肝细胞会长时间的关键性都和是甲基化PTMs,主要存在于甲基化H3和H4的脚掌上。因此,在细胞会分裂的非常进一步中的,除了DNA复制,子代核小体也需要重建,并分派到子代细胞会中的。确实,研究工作推测子代的经典甲基化(比如复制依赖的甲基化)但会在复制叉后迅速再次组装。不尽都与同的研究工作组推测H3K9me3和H3K27me2/3可通过生物合成遗传学。然而,这两个甲基化去除都是与抑制作用性肝细胞会内部结构都与关。那么,子代中的的核小体,以及它们携带的甲基化PTMs是否都能遗传学到子代细胞会都与奇异的性状观众席上呢?来自哥伦比亚大学兰戈恩医学中的心的Danny Reinberg教授课题组在Cell刊发研究工作Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该研究工作推测在DNA复制时,酪氨酸与颇受抑制作用肝细胞会地带的核小体除去是不尽都与同的。颇受抑制作用肝细胞会内部结构中的的核小所想被就近在子代细胞会都与奇异的性状地带,而酪氨酸HG肝细胞会内部结构中的的核小体的分派则是强磁场和随机的。为研究工作核小体的除去持续性,科学界在候选性状观众席不可逆的标明甲基化H3.1和H3.2,以小鼠颇受精肿瘤细胞会中的核小体在细胞会分裂时的变化。简单来说,该方法有通过邻近酶标明技术,利用CRISPR为特定性状观众席的H3.1和H3.2带上糖类标明,经ChIP-qPCR检查该糖类标明在细胞会周期G1期和S期的丰度,以反应核小体的除去持续性。若该核糖体H3.1和H3.2上的糖类标明在一次细胞会分裂后回升一半,暗示该核小体被就近在了两个子代细胞会的都与奇异性状观众席上;若该糖类去除很快不复存在,暗示子代细胞会并未遗传学该性状观众席的核小体。科学界首先检查了在颇受精肿瘤细胞会中的沉默表达出来的Hoxc6, Ebf1, Meis2性状的核小体除去持续性。这些性状观众席的核小体糖类高水平随细胞会分裂慢慢大幅提高,这提示颇受抑制作用的性状观众席的核小所想被就近在子代细胞会的都与奇异位置。这与不足之处推测的H3K9me3和H3K27me2/3可通过生物合成遗传学的现象都与印证。那么,酪氨酸HG肝细胞会地带的核小体又是如何除去的呢?科学界检查了在颇受精肿瘤细胞会中的被酪氨酸表达出来的Ccna2, Nanog和Pou5f1性状,推测该性状观众席的糖类标明在细胞会分裂后呈强磁场长时间,丰度很低,这提示对于酪氨酸HG肝细胞会地带来说,子代核小体没有人简单的分派到子代细胞会都与应的性状观众席,而是随机分派的。非常有趣的是,在诱导颇受精肿瘤细胞会分化时,Hoxc6性状由抑制作用转成酪氨酸,它的核小体分派模式也由简单的同核糖体分派改成随机分派。这暗示子代核小体的局部分派,可以揭示该肝细胞会地带的活性长时间。总的来说,该研究工作通过CRISPR引导的甲基化糖类标明系统,研究工作了核小体在细胞会分裂非常进一步中的的分式,并推测酪氨酸与颇受抑制作用的肝细胞会地带的核小体分式的不尽都与同。相比较的是,在细胞会周期的S前所的,颇受抑制作用的肝细胞会地带的复制要晚于酪氨酸HG肝细胞会地带。这个时间差奇异也导致常肝细胞会的复制速率远大于奇异肝细胞会。奇异肝细胞会都与对较慢的复制速度可能保证了核小体的简单分派,而常肝细胞会中的的PTMs则由都与应的主调节突变(master regulators)直接识别系统都与应DNA脱氧核糖核酸,并雇用PTMs酶再次建起。非常早出处:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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