Cell | 细胞器激活或抑制状态决定了核小体分离的差异性

2021-10-19 20:04:52 来源:
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核糖本体通过促进或诱发该本体的RNA可以遏制突变组的新功能和细胞此前应属。这些核糖本体之前存在特定的突变物质中文后修饰(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定RNA正最常具体,并可促进之前枢神经染色体本体的形成,阻碍突变的表述。为了在增生时依然保持突变表述程序的完整性,决定核糖本体的分子外观上也需要在子代细胞之前建立。建立两者之间近多种类DF核糖正最常的重要一般说来是突变物质PTMs,主要存在于突变物质H3和H4的鬃毛上。因此,在增生的每一次之前,除了DNA拷贝,特异性核小体也需要重建,并分派到子代细胞之前。确实,研究工作见到特异性的经典突变物质(比如拷贝忽视的突变物质)会在拷贝叉后迅速继续制造。两者之间近的研究工作组见到H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂突变。然而,这两个突变物质修饰都是与之前枢神经核糖本体具体。那么,特异性之前的核小体,以及它们装载的突变物质PTMs是否都能突变到子代细胞两者之间近的突变正之前央上呢?来自纽约大学兰戈恩医学之前心的Danny Reinberg教授课题组在Cell刊出研究工作Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该研究工作见到在DNA拷贝时,诱导与均受诱发核糖范围的核小体均受控是两者之间近的。均受诱发核糖本体之前的核小体会被收容在子代细胞两者之间近的突变范围,而诱导DF核糖本体之前的核小体的分派则是弥散和随机的。为研究工作核小体的均受控状况,研究工作者在候选突变正之前央不可逆的标示出突变物质H3.1和H3.2,以小鼠胚胎体细胞之前核小体在增生时的变化。简单来说,该方法通过周边蛋白标示出技术,利用CRISPR为特定突变正之前央的H3.1和H3.2带着丙二酸标示出,经ChIP-qPCR检测该丙二酸标示出在细胞周期G1期和S期的稀土元素,以反应核小体的均受控状况。若该碱基H3.1和H3.2上的丙二酸标示出在一次增生后下降一半,详述该核小体被收容在了两个子代细胞的两者之间近突变正之前央上;若该丙二酸修饰很快消失,详述子代细胞并未突变该突变正之前央的核小体。研究工作者首先检测了在胚胎体细胞之前寂静表述的Hoxc6, Ebf1, Meis2突变的核小体均受控状况。这些突变正之前央的核小体丙二酸高度随增生不断减半,这指引均受诱发的突变正之前央的核小体会被收容在子代细胞的两者之间近前面。这与前人见到的H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂突变的物理现象两者之间印证。那么,诱导DF核糖范围的核小体又是如何均受控的呢?研究工作者检测了在胚胎体细胞之前被诱导表述的Ccna2, Nanog和Pou5f1突变,见到该突变正之前央的丙二酸标示出在增生后呈弥散正最常,稀土元素很低,这指引对于诱导DF核糖范围来说,特异性核小体没有准确的分派到子代细胞两者之间应的突变正之前央,而是随机分派的。更有趣的是,在诱导胚胎体细胞分化时,Hoxc6突变由诱发转用诱导,它的核小体分派模式也由准确的同碱基分派改为随机分派。这详述特异性核小体的局部分派,可以反映该核糖范围的活性正最常。总的来说,该研究工作通过CRISPR为了让的突变物质丙二酸标示出系统,研究工作了核小体在增生每一次之前的等价,并见到诱导与均受诱发的核糖范围的核小体等价的两者之间近。在在的是,在细胞周期的S期之前,均受诱发的核糖范围的拷贝要晚于诱导DF核糖范围。这个时间差异也引致最常核糖的拷贝频率大于异核糖。异核糖两者之间对较慢的拷贝速度可能保证了核小体的准确分派,而最常核糖之前的PTMs则由两者之间应的主调节系数(master regulators)直接鉴别两者之间应DNA氨基酸,并招募PTMs酶继续建立。在在出处:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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